mercredi 6 janvier 2016

Utiliser Quercus (B-VegAna) pour informatiser des relevés phytosociologiques

Introduction

Quercus est un logiciel de la suite B-VegAna (Biodiversity and Vegetation Analysis) développée par l'équipe de Miquel de Cacéres au sein de l'université de Barcelone (Espagne).
Cette suite de logiciels utilise la technologie Java ce qui la rend disponible sur tous les systèmes d'exploitation (Windows, Mac, Linux) en faisant un outil portable. Sa gratuité fini de la rendre accessible à n'importe quel utilisateur.

Les logiciels de la suite B-VegAna ont pour objet la digitalisation d'observations d'êtres vivants et en particulier les plantes et la végétation.
Les quatres principaux logiciels (modules) de cette suite sont les suivants :
- Fagus : pour entrer des observations floristiques (relevés floristiques et citations issues de la bibliographie),
- Quercus : pour rentrer des relevés de végétation (relevés phytosociologiques),
- Ginkgo : pour réaliser des analyses multivariées à partir des jeu de données enregistrés dans Fagus et/ou Quercus,
- Yucca : est une interface SIG pour afficher les données enregistrées dans Fagus et/ou Quercus.

On trouvera dans le manuel "Gestion des habitats naturels et biodiversité" de J.B. Bouzillé, des instructions de base pour débuter avec Ginkgo.

Installation


Il suffit de cliquer sur le bouton d'exécution du programme situé dans le bandeau de droite sur la page d'accueil de B-VegAna afin d'exécuter l'un des quatre modules listés précédemment.
Le programme s'exécute depuis les serveurs de l'université de Barcelone, le seul prérequis est la présence sur l'ordinateur de l'utilisateur de Java (JRE) et de Java Web Start.

On peut tout à fait enregistrer le lien d'exécution comme favoris : voici le lien du module Quercus :

http://biodiver.bio.ub.es/veganaweb/resources/jnlp/quercus.jnlp

[article en cours de rédaction]